複数接続時のエラーの一つにUSBハブの電源供給の問題があります。
PCのUSBホストが不安定(電流供給過多)が原因が考えられます。
iOSであれば、IPSWのダウンロードを行うためにiPhoneが接続されている時間が長く、その為にUSBホストから電流を供給している時間も長くなり 症状が出やすいものと想像できます。
これについては、ACアダプタ付きの(給電可能な)USBハブを介してもらうことで、回避できると思います。